南通大学最好专业无法一概而论,因为每个专业都有其独特的优势和特点。然而,根据学科实力和社会需求,南通大学数学与信息科学学院、生命科学学院、物理科学与技术学院等学院在各自领域内有着较高的学术水平和影响力。此外,南通大学工程学院的工程类专业也备受好评,毕业生就业率较高。总的来说,南通大学的每个学院都有其优秀的专业,学生可以根据自己的兴趣和职业规划选择最适合自己的专业方向。