保护梅家大院的合理措施包括加强法制保护，制定相关法律法规，确保文化遗产的合法权益。应通过加大资金投入、修缮古建筑和维护环境来保持其原貌与风格。此外，发展相应的旅游管理，限制过度开发，减少人流对遗址的损害。同时，注重宣传教育，增强公众对梅家大院文化价值的认识，提高社会参与度，鼓励地方社区积极参与保护工作。最后，通过建立科学的监测系统，及时发现与解决问题，确保大院的可持续发展与传承。
