全日制自主招生学校与全日制普通院校的区别在于入学方式和招生标准。全日制自主招生学校通过自主招生考试选拔学生,学生可以根据自己的兴趣和特长选择学校和专业,招生标准相对更为灵活。而全日制普通院校则通过高考录取学生,按照普通的招生标准选拔学生,学生需要参加高考并获得一定分数才能被录取。另外,全日制自主招生学校通常注重培养学生的创新能力和实践能力,教学方式更为灵活多样。