断头谷骑士最后带走继母的原因是因为他认为她是犹太人,而当时的德国对犹太人进行大规模的迫害。断头谷骑士被希特勒派遣去清除犹太人,但在执行任务的过程中,他发现自己的继母也是犹太人。面对这个事实,他感到无法直接执行任务,所以选择了最后带走继母,让她免于被杀害。这个决定展现了断头谷骑士的良知和道德担当。