房屋在建成后如果经过五年没有被相关部门认定为违章建筑，通常被认为是合法的。这是因为，根据我国土地和建筑管理法律，建筑物的合法性与其建设时的法律法规密切相关。五年是一个有期限的时效，过了这个时间段，相关部门便不再对建筑物进行追溯性执法，原有的违法状态可能因沉默时间而不再被追究。此外，地方政府有时会对特定情况下的建筑物采取包容政策，允许其存留。因此，五年后未被拆除的房屋通常不再视为违章建筑。
