工程项目承包所得的利润是合法的,前提是在合同约定和相关法律法规的范围内进行。承包商通过承包项目获得利润是正常的商业行为,其利润来自于承包项目的投入、管理、风险承担和技术创新等方面。在确保质量、安全和合同履行的基础上,承包商有权获得相应的报酬。同时,承包商需要遵守竞标规则和相关税收法律,否则获得的利润可能存在违法行为。