南京市6字头号码是江宁区的。从号码规律来看,南京市的车牌号码分为苏AJ、苏H、苏D、苏C、苏B和苏E六个序列,其中南京市江宁区的车牌号码属于苏E序列,也就是以E开头。因此,南京市6字头号码的车辆都是属于江宁区的。江宁区是南京市的一个重要行政区域,拥有着丰富的历史文化和自然资源,是南京市的一个繁荣发展的地区。