古代玉门关的位置并非一直固定不变。原本的玉门关位于今天的新疆疏勒县西南,后来由于地质变迁和战争等原因,多次被毁重建。现今被称为玉门关的遗址位于甘肃敦煌市西南约90公里处。该遗址位于原丝绸之路上,扼守西域进入中原的重要通道,历史上曾多次重建并维护。虽然位置有所变动,但其重要性和历史价值尤存。